Ο αριθμός CAS για το Νευροπεπτίδιο Υ (χοίρος) είναι 83589-17-7. έχει μοριακό τύπο C190H287N55O57 και μοριακό βάρος περίπου 4253,70. Το νευροπεπτίδιο Υ (άνθρωπος/αρουραίος) έχει τον αριθμό CAS 90880-35-6, τον μοριακό τύπο C189H285N55O57S και ένα μοριακό βάρος περίπου 4271,68. Η αποθήκευση απαιτεί συνήθως ψύξη στους -20 βαθμούς. Το NPY διαθέτει μια μοναδική διαμόρφωση που μοιάζει με φουρκέτα, γνωστή ως πτυχή "παγκρεατικού πολυπεπτιδίου".
Το νευροπεπτίδιο Υ είναι ευρέως κατανεμημένο σε όλο το κεντρικό νευρικό σύστημα. Η συγκέντρωσή του είναι υψηλότερη στον ιππόκαμπο, ακολουθούμενο από τον εγκεφαλικό φλοιό, τον υποθάλαμο, τον θάλαμο, το εγκεφαλικό στέλεχος και την παρεγκεφαλίδα. Ο τοξοειδής πυρήνας του υποθαλάμου είναι μια κύρια θέση σύνθεσης NPY. Συγκεκριμένοι πληθυσμοί νευρώνων που εκφράζουν NPY-βρίσκονται στον ραχιαίο πυρήνα της ράχης και στο κοιλιακό πλάγιο περιαγωγικό γκρίζο του εγκεφαλικού στελέχους. Στο περιφερικό νευρικό σύστημα, το NPY κυρίως συν-εντοπίζεται με τη νορεπινεφρίνη στα συμπαθητικά νεύρα και απελευθερώνεται από τα τερματικά του συμπαθητικού νεύρου. Το καρδιαγγειακό σύστημα περιέχει άφθονες νευρικές ίνες NPY, με το NPY να είναι ευρέως κατανεμημένο γύρω από την καρδιά και τα αιμοφόρα αγγεία.
